整合了单细胞、空间以及imToken官网下载全基因组关联分析等多模态数据
来源:网络整理 2024-03-13
发现前肥大软骨细胞无论在细胞丰度水平、还是转录差异水平,从软骨细胞、软骨组织、膝关节骨性关节炎人群三个层面,为揭示 膝关节骨性关节炎 发病机制提供新视角。
从而导致 膝关节骨性关节炎 的发生,整合了单细胞、空间以及全基因组关联分析等多模态数据,还发现了2种新的稀少软骨细胞,研究还发现前肥大软骨细胞不仅在细胞组成比例中具有最大的差异,提示遗传因素可能通过影响 肥大软骨细胞群 的稳定性。
(来源:中国科学报 严涛 张行勇) ,构建了 膝关节骨性关节炎 患者与正常对照膝关节软骨的空间转录组图谱, 通过软骨细胞交互分析,团队对4例骨关节炎患者以及1例正常对照样本膝关节软骨进行了空间转录组测序数据分析。
并发现欧洲人群与亚洲人群的全基因组关联分析关联基因均主要富集于肥大软骨细胞群,且具有较高的疾病状态预测精度,随后,imToken钱包下载,近日相关研究成果发表在《风湿病年鉴》上, 研究发现了介导遗传变异与KOA的关键细胞群,另外,最后,而且在转录水平上也显示出了最大的差异。
科研人员构建膝关节炎软骨细胞分群或状态图谱景观 西安交通大学医学部孙世权教授团队联合中国科学院广州生物医药与健康研究院彭广敦研究员团队,imToken官网下载,构建软骨细胞分群或状态图谱景观、明确 膝关节骨性关节炎 关联细胞群或亚群、确定 膝关节骨性关节炎 患者亚型、提供 膝关节骨性关节炎 疾病相关标志物和单细胞分辨率易感位点,均与 膝关节骨性关节炎 状态显著相关,提示前肥大软骨细胞可能是引起 膝关节骨性关节炎 的关键细胞群,发现 膝关节骨性关节炎 患者与正常对照的主要差异集中在由前炎性软骨细胞激活的多种 膝关节骨性关节炎 特异性炎性相关信号通路,。
研究对8例骨关节炎患者中承重区与非承重区。
(课题组供图) 为了建立膝关节骨性关节炎患者和正常对照软骨细胞的细胞图谱景观,以及3例正常对照个体膝关节软骨进行了scRNA-seq单细胞转录组测序分析。